Odjel za južnu Dalmaciju obavlja inspekcijske, upravne i stručne poslove na teritoriju jedinice lokalne i regionalne (područne) samouprave koji se odnose na nadzor nad prometom predmeta opće uporabe;
- nadzor i zaštitu pučanstva od ionizirajućih i neionizirajućih zračenja;
- zaštitu pučanstva od zaraznih bolesti;
- nadzor nad zdravstvenom ispravnosti hrane u proizvodnji i prometu;
- nadzor nad prometom, uporabom i zbrinjavanjem kemikalija;
- nadzor nad prometom genetski modificiranih organizama;
- obavlja sanitarno-inspekcijski nadzor nad izgradnjom građevina koje podliježu sanitarnom nadzoru, građevinama i uređajima za javnu vodoopskrbu do 50.000 ekvivalentnih stanovnika te uređajima za pročišćavanje otpadnih voda do 50.000 ekvivalentnih stanovnika;
- obavlja nadzor nad provođenjem javno-zdravstvenih mjera za zaštitu zdravlja ljudi od štetnih čimbenika okoliša, brine da je svaki rashod opravdan stvarnom potrebom i potvrđen prethodnom kontrolom.
Za obavljanje poslova Odjela za južnu Dalmaciju ustrojavaju se:
8.3.6.1. Odsjek za Splitsko-dalmatinsku županiju – područna jedinica sa sjedištem u Splitu, koji obavlja poslove iz djelokruga rada Odjela na području Splitsko-dalmatinske županije. Odsjek ima ispostave u:
- Makarskoj,
- Hvaru,
- Imotskom,
- Omišu,
- Solinu,
- Sinju,
- Visu,
- Trogiru,
- Kaštelima,
- Braču i
- Vrgorcu.
8.3.6.2. Odsjek za Dubrovačko-neretvansku županiju – područna jedinica sa sjedištem u Dubrovniku, koji obavlja poslove iz djelokruga rada Odjela na području Dubrovačko-neretvanske županije. Odsjek ima ispostave u:
- Pločama,
- Metkoviću,
- Korčuli.