Odjel za Dalmaciju – područna jedinica sa sjedištem u Splitu, obavlja inspekcijski nadzor iz djelokruga rada Službe na području Dalmacije. Odjel ima ispostave u:
- Šibeniku,
- Zadru,
- Pločama (Metković) i
- Dubrovniku.
U ispostavama odjela – područnih jedinica predviđaju se samostalni izvršitelji. Odjeli – područne jedinice i samostalni izvršitelji u ispostavama područnih jedinica – odjela u Službi za graničnu sanitarnu inspekciju u pravilu obavljaju poslove na područjima za koja su ustrojeni, a prema nalogu ministra mogu obavljati poslove i na drugim područjima.